Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo1Q7TT28 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms