Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms