Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH2

Phkb, Phosphorylase b kinase regulatory subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PhkbQ7TSH2 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PhkbQ7TSH2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PhkbQ7TSH2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PhkbQ7TSH2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PhkbQ7TSH2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PhkbQ7TSH2 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PhkbQ7TSH2 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PhkbQ7TSH2 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PhkbQ7TSH2 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PhkbQ7TSH2 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PhkbQ7TSH2 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PhkbQ7TSH2 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PhkbQ7TSH2 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PhkbQ7TSH2 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PhkbQ7TSH2 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PhkbQ7TSH2 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PhkbQ7TSH2 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PhkbQ7TSH2 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms