Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Dsg1cQ7TSF0 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dsg1cQ7TSF0 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms