Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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