Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nphp3Q7TNH6 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nphp3Q7TNH6 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nphp3Q7TNH6 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Nphp3Q7TNH6 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Nphp3Q7TNH6 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Nphp3Q7TNH6 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nphp3Q7TNH6 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nphp3Q7TNH6 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nphp3Q7TNH6 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nphp3Q7TNH6 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nphp3Q7TNH6 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nphp3Q7TNH6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nphp3Q7TNH6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nphp3Q7TNH6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nphp3Q7TNH6 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nphp3Q7TNH6 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nphp3Q7TNH6 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nphp3Q7TNH6 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nphp3Q7TNH6 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nphp3Q7TNH6 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nphp3Q7TNH6 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nphp3Q7TNH6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nphp3Q7TNH6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nphp3Q7TNH6 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nphp3Q7TNH6 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nphp3Q7TNH6 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nphp3Q7TNH6 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nphp3Q7TNH6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nphp3Q7TNH6 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nphp3Q7TNH6 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nphp3Q7TNH6 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nphp3Q7TNH6 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nphp3Q7TNH6 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nphp3Q7TNH6 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nphp3Q7TNH6 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nphp3Q7TNH6 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nphp3Q7TNH6 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nphp3Q7TNH6 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nphp3Q7TNH6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nphp3Q7TNH6 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nphp3Q7TNH6 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nphp3Q7TNH6 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nphp3Q7TNH6 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nphp3Q7TNH6 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nphp3Q7TNH6 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nphp3Q7TNH6 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nphp3Q7TNH6 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nphp3Q7TNH6 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nphp3Q7TNH6 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nphp3Q7TNH6 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nphp3Q7TNH6 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nphp3Q7TNH6 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nphp3Q7TNH6 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nphp3Q7TNH6 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms