Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Rnf139Q7TMV1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf139Q7TMV1 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf139Q7TMV1 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf139Q7TMV1 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf139Q7TMV1 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf139Q7TMV1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf139Q7TMV1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf139Q7TMV1 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf139Q7TMV1 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Rnf139Q7TMV1 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Rnf139Q7TMV1 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf139Q7TMV1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf139Q7TMV1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Rnf139Q7TMV1 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Rnf139Q7TMV1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Rnf139Q7TMV1 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rnf139Q7TMV1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rnf139Q7TMV1 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rnf139Q7TMV1 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rnf139Q7TMV1 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rnf139Q7TMV1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rnf139Q7TMV1 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf139Q7TMV1 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf139Q7TMV1 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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