Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
ScocQ78YZ6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ScocQ78YZ6 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms