Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rph3alQ768S4 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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