Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Ccdc88cQ6VGS5 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Ccdc88cQ6VGS5 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Ccdc88cQ6VGS5 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Ccdc88cQ6VGS5 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Ccdc88cQ6VGS5 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Ccdc88cQ6VGS5 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc88cQ6VGS5 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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