Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Gja6Q6S5G4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja6Q6S5G4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms