Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Krt9Q6RHW0 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Krt9Q6RHW0 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Krt9Q6RHW0 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Krt9Q6RHW0 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms