Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms