Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms