Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim37Q6PCX9 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms