Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Usp49Q6P9L4 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Usp49Q6P9L4 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Usp49Q6P9L4 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Usp49Q6P9L4 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Usp49Q6P9L4 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Usp49Q6P9L4 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Usp49Q6P9L4 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp49Q6P9L4 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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