Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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