Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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Tpm4Q6IRU2 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Tpm4Q6IRU2 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Tpm4Q6IRU2 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Tpm4Q6IRU2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Tpm4Q6IRU2 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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Tpm4Q6IRU2 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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