Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Krt40Q6IFX3 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Krt40Q6IFX3 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Krt40Q6IFX3 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Krt40Q6IFX3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Krt40Q6IFX3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt40Q6IFX3 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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