Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Pkp4Q68FH0 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Pkp4Q68FH0 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Pkp4Q68FH0 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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Pkp4Q68FH0 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Pkp4Q68FH0 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Pkp4Q68FH0 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Pkp4Q68FH0 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Pkp4Q68FH0 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Pkp4Q68FH0 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Pkp4Q68FH0 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Pkp4Q68FH0 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Pkp4Q68FH0 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Pkp4Q68FH0 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Pkp4Q68FH0 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Pkp4Q68FH0 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pkp4Q68FH0 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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