Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Top2bQ64511 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top2bQ64511 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms