Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PtprdQ64487 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprdQ64487 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms