Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Surf4Q64310 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Surf4Q64310 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Surf4Q64310 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Surf4Q64310 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Surf4Q64310 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Surf4Q64310 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Surf4Q64310 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms