Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc18Q640L5 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc18Q640L5 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms