Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms