Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Polr2kQ63871 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms