Protein–RNA interactions for Protein: Q62425

Ndufa4, Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa4Q62425 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufa4Q62425 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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