Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sema3cQ62181 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3cQ62181 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3cQ62181 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3cQ62181 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3cQ62181 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3cQ62181 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3cQ62181 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3cQ62181 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sema3cQ62181 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms