Protein–RNA interactions for Protein: Q62147

Sspn, Sarcospan, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SspnQ62147 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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SspnQ62147 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SspnQ62147 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SspnQ62147 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SspnQ62147 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SspnQ62147 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SspnQ62147 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SspnQ62147 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SspnQ62147 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SspnQ62147 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SspnQ62147 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SspnQ62147 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SspnQ62147 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SspnQ62147 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SspnQ62147 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SspnQ62147 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SspnQ62147 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SspnQ62147 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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SspnQ62147 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SspnQ62147 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SspnQ62147 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SspnQ62147 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SspnQ62147 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SspnQ62147 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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SspnQ62147 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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SspnQ62147 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SspnQ62147 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SspnQ62147 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SspnQ62147 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SspnQ62147 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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SspnQ62147 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SspnQ62147 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SspnQ62147 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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SspnQ62147 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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SspnQ62147 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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SspnQ62147 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SspnQ62147 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SspnQ62147 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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SspnQ62147 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SspnQ62147 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SspnQ62147 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SspnQ62147 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SspnQ62147 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SspnQ62147 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SspnQ62147 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SspnQ62147 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SspnQ62147 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SspnQ62147 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SspnQ62147 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SspnQ62147 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SspnQ62147 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SspnQ62147 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SspnQ62147 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SspnQ62147 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SspnQ62147 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SspnQ62147 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
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