Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga6Q61739 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga6Q61739 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms