Protein–RNA interactions for Protein: Q61510

Trim25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim25Q61510 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim25Q61510 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim25Q61510 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim25Q61510 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim25Q61510 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms