Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ecm1Q61508 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ecm1Q61508 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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