Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rbbp4Q60972 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms