Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot7Q60809 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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