Protein–RNA interactions for Protein: Q60766

Irgm1, Immunity-related GTPase family M protein 1, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irgm1Q60766 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Irgm1Q60766 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Irgm1Q60766 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Irgm1Q60766 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Irgm1Q60766 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Irgm1Q60766 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Irgm1Q60766 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irgm1Q60766 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.4 ms