Protein–RNA interactions for Protein: Q60715

P4ha1, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4ha1Q60715 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P4ha1Q60715 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms