Protein–RNA interactions for Protein: Q60714

Slc27a1, Long-chain fatty acid transport protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a1Q60714 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc27a1Q60714 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms