Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SkiQ60698 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SkiQ60698 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SkiQ60698 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SkiQ60698 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SkiQ60698 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SkiQ60698 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SkiQ60698 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SkiQ60698 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SkiQ60698 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SkiQ60698 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SkiQ60698 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SkiQ60698 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SkiQ60698 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms