Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms