Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms