Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eme2Q56A04 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms