Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc110Q3V125 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms