Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Y1

Ppp4r3c, Protein PPP4R3C, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ppp4r3cQ3V0Y1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp4r3cQ3V0Y1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp4r3cQ3V0Y1 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp4r3cQ3V0Y1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp4r3cQ3V0Y1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp4r3cQ3V0Y1 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp4r3cQ3V0Y1 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp4r3cQ3V0Y1 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp4r3cQ3V0Y1 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ppp4r3cQ3V0Y1 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp4r3cQ3V0Y1 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp4r3cQ3V0Y1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp4r3cQ3V0Y1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp4r3cQ3V0Y1 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp4r3cQ3V0Y1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp4r3cQ3V0Y1 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms