Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms