Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms