Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPE3

Rmi2, RecQ-mediated genome instability protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmi2Q3UPE3 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rmi2Q3UPE3 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rmi2Q3UPE3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rmi2Q3UPE3 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rmi2Q3UPE3 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rmi2Q3UPE3 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rmi2Q3UPE3 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rmi2Q3UPE3 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rmi2Q3UPE3 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rmi2Q3UPE3 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rmi2Q3UPE3 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rmi2Q3UPE3 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rmi2Q3UPE3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rmi2Q3UPE3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rmi2Q3UPE3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rmi2Q3UPE3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rmi2Q3UPE3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rmi2Q3UPE3 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rmi2Q3UPE3 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rmi2Q3UPE3 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rmi2Q3UPE3 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Rmi2Q3UPE3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Rmi2Q3UPE3 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Rmi2Q3UPE3 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Rmi2Q3UPE3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Rmi2Q3UPE3 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Rmi2Q3UPE3 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Rmi2Q3UPE3 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Rmi2Q3UPE3 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rmi2Q3UPE3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms