Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 1,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Nlrc4Q3UP24 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Nlrc4Q3UP24 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Nlrc4Q3UP24 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Nlrc4Q3UP24 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Nlrc4Q3UP24 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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Nlrc4Q3UP24 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc4Q3UP24 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms