Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Cog7Q3UM29 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Cog7Q3UM29 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Cog7Q3UM29 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Cog7Q3UM29 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Cog7Q3UM29 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cog7Q3UM29 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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