Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc33Q3ULW6 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc33Q3ULW6 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms