Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms